O departamento de engenharia é formado por duas equipes especializadas, que desempenham as funções de certificação e desenvolvimento de novos produtos para aeronaves civis e militares.
Uma equipe de engenheiros é responsável pela elaboração e gerenciamento de todos os processos de homologação e certificação dos projetos de aviônicos junto aos órgãos competentes de qualquer país. São engenheiros RCE (Representantes Credenciados em Engenharia), capacitados pela Agência Nacional de Aviação Civil (ANAC), e também exercem consultoria para outras empresas, no gerenciamento e certificação de projetos. Em alguns casos, ainda fazem vistorias técnicas para a própria ANAC.
Outra equipe trabalha no desenvolvimento de equipamentos de uso aeronáutico, para aeronaves civis e militares, e nos projetos de instalação e customização dos equipamentos. Atualmente, além dos produtos de marca própria, desenvolvem-se também novos equipamentos para a Embraer e outras grandes empresas da aviação.
